W latach osiemdziesiątych zaproponowano mu zastąpienie perkusisty w metalowym zespole Fates Warning w trakcie nagrywania "Perfect Symmetry". Praca przedłużyła się do sześciu kolejnych albumów studyjnych i dwóch live, a także tras koncertowych. Mark ewoluował ze stylu metalowego w hard rockowy. W roku 2002 zespół zjednoczył się w celu wydania "Rising Out of The Ashes" z Joacimem Cansem w roli wokalisty. Ponadto pojawili się podczas Wacken Festival w Niemczech przed czterdziestotysięczną publiką. W czasach Warlord pracował także u boku różnorodnych artystów, powiązanych z wieloma gatunkami muzycznymi - m.in. Plane English. Rozwinął swoją umiejętność gry na perkusji elektronicznej, co stało się wkrótce znakiem rozpoznawczym jego techniki.
W roku 2007 Mark podjął się uformowania zespołu Slavior, z którym jest powiązany do dziś. Członkami zespołu są także Wayne Findlays, Philip Bynoe i Gregg Anala. Tego samego roku kwartet wydał debiutancki album dla europejskiej wytwórni płytowej Inside Out. Krążek doceniony został przez publiczność i krytyków, którzy nazwali go "świeżym, oryginalnym i nowoczesnym". Ponadto pojawili się w Japonii i Stanach Zjednoczonych.Mark Zonder ceniony jest ze względu na profesjonalizm z jakim podchodzi do każdego projektu, którego się podejmuje. Wykazuje się kreatywnością i zaangażowaniem, ponieważ jak sam twierdzi, chce odegrać jak najlepszą rolę w procesie powstawania muzyki.
"Ostatecznie chodzi o to w jaki sposób muzyk wpasuje się w sytuacje - koncert, nagranie studyjne - i czy postara się uczynić je doskonałymi. To że potrafisz zagrać doskonałe riffy, nie oznacza, że musisz użyć ich, jeśli nie wymaga tego zamierzony efekt końcowy."